Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPOP42166 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPOP42166 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPOP42166 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPOP42166 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms