Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FLT4P35916 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLT4P35916 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLT4P35916 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms