Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD13P35453 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms