Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.65e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 NDUFS3-210ENST00000533105 567 ntTSL 424.35■■□□□ 1.495e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-217ENST00000486677 322 ntTSL 524.33■■□□□ 1.495e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.45e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.385e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.325e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.295e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 RENBP-203ENST00000423624 1304 ntTSL 523.04■■□□□ 1.285e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-204ENST00000433715 765 ntTSL 322.88■■□□□ 1.255e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.245e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.225e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ATP1A1-204ENST00000418797 654 ntTSL 322.61■■□□□ 1.215e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.25e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.185e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.155e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ATG2A-204ENST00000461701 2031 ntTSL 222.18■■□□□ 1.145e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.115e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 NDUFS3-202ENST00000524568 733 ntTSL 221.96■■□□□ 1.115e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ATP1A1-208ENST00000488733 1728 ntTSL 221.94■■□□□ 1.15e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 MROH1-203ENST00000525287 2065 ntTSL 221.94■■□□□ 1.15e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PLA2G6-225ENST00000491986 753 ntTSL 221.91■■□□□ 1.15e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.075e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.065e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.995e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.975e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.935e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.935e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.935e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-206ENST00000436844 854 ntTSL 520.34■□□□□ 0.855e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 RENBP-204ENST00000442361 817 ntTSL 320.33■□□□□ 0.855e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PLA2G6-214ENST00000448094 1147 ntTSL 520.25■□□□□ 0.835e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.765e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.755e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 219.69■□□□□ 0.745e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ANKRD36-203ENST00000452478 986 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.685e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-213ENST00000470867 678 ntTSL 518.62■□□□□ 0.575e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.575e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-217ENST00000496539 571 ntTSL 218.45■□□□□ 0.545e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 TRIM28-215ENST00000601150 915 ntTSL 318.4■□□□□ 0.545e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.475e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 RAC2-206ENST00000469532 752 ntTSL 217.74■□□□□ 0.435e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 NDUFS3-208ENST00000530295 253 ntTSL 317.52■□□□□ 0.45e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.375e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-203ENST00000418438 556 ntTSL 417.27■□□□□ 0.365e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PLA2G6-218ENST00000454670 741 ntTSL 317.13■□□□□ 0.335e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 NDUFS3-209ENST00000531351 423 ntTSL 517■□□□□ 0.315e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.295e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.285e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.275e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 216.2■□□□□ 0.185e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.155e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 215.85■□□□□ 0.135e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.115e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-209ENST00000461116 420 ntTSL 215.41■□□□□ 0.065e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.055e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 DIAPH1-210ENST00000494967 629 ntTSL 215.21■□□□□ 0.035e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.035e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.025e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.035e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.045e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 TRIM28-212ENST00000597995 702 ntTSL 214.27□□□□□ -0.135e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.166e-9■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.165e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-204ENST00000396675 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.175e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 FAM173B-202ENST00000504390 571 ntTSL 513.8□□□□□ -0.25e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PLA2G6-201ENST00000332509 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.225e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-213ENST00000455539 1956 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.255e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.275e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PHYKPL-202ENST00000323594 739 ntTSL 513.32□□□□□ -0.285e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.285e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-210ENST00000463464 707 ntTSL 213.15□□□□□ -0.35e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.335e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 DIAPH1-209ENST00000491754 557 ntTSL 412.91□□□□□ -0.345e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PLA2G6-224ENST00000490473 601 ntTSL 412.8□□□□□ -0.365e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 FAM173B-206ENST00000510052 534 ntTSL 512.75□□□□□ -0.375e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 FAM173B-207ENST00000511437 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.445e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ANKRD36-206ENST00000620383 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.445e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-215ENST00000470696 800 ntTSL 512.15□□□□□ -0.465e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 512□□□□□ -0.495e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.495e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.515e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 FAM173B-205ENST00000510047 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.535e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 POLD2-208ENST00000456038 665 ntTSL 311.71□□□□□ -0.535e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-209ENST00000422063 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.65e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 UPF1-213ENST00000601981 556 ntTSL 510.69□□□□□ -0.75e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PHYKPL-217ENST00000511716 562 ntTSL 310.58□□□□□ -0.725e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-205ENST00000401396 1742 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.745e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 FAM173B-201ENST00000280330 1928 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.765e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 LINC00963-206ENST00000453213 469 ntTSL 310.13□□□□□ -0.795e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 FAM173B-203ENST00000506108 751 ntTSL 58.88□□□□□ -0.995e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 PHYKPL-205ENST00000476170 824 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.995e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 DIAPH1-212ENST00000518484 546 ntTSL 48.08□□□□□ -1.125e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 ICA1-203ENST00000339809 1415 ntTSL 1 (best)8.01□□□□□ -1.135e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 USP10-217ENST00000569925 572 ntTSL 37.53□□□□□ -1.25e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 USP10-214ENST00000567526 330 ntTSL 36.36□□□□□ -1.395e-6■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 XPO1-211ENST00000451765 643 ntTSL 318.42■□□□□ 0.541e-13■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.221e-13■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.253e-7■■□□□ 13.8
GTF2F1P35269 MBD3-210ENST00000592361 907 ntTSL 519.08■□□□□ 0.643e-7■■□□□ 13.8
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 97.1 ms