Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP6P35125 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP6P35125 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP6P35125 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP6P35125 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP6P35125 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP6P35125 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP6P35125 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP6P35125 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms