Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA3P34903 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA3P34903 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms