Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC25CP30307 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms