Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK6P29122 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK6P29122 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms