Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VAMP1P23763 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms