Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGFR3P22607 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms