Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN1P18031 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms