Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME1P15531 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME1P15531 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME1P15531 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME1P15531 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME1P15531 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME1P15531 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME1P15531 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME1P15531 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms