Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD8P13378 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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