Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH1P12830 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH1P12830 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH1P12830 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDH1P12830 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms