Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT3P12035 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT3P12035 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT3P12035 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT3P12035 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT3P12035 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT3P12035 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT3P12035 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms