Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms