Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGAP10645 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGAP10645 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms