Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13BP05160 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F13BP05160 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13BP05160 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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