Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP104O60308 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP104O60308 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP104O60308 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms