Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms