Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms