Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNQ3O43525 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNQ3O43525 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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