Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRTO14522 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRTO14522 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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