Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms