Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
J3QQQ9 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms