Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms