Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms