Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms