Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR3Q9UNL2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms