Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN2Q9UNF0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms