Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMCC3Q9ULS5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMCC3Q9ULS5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMCC3Q9ULS5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMCC3Q9ULS5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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