Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB23Q9ULC3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB23Q9ULC3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms