Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms