Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEFF2Q9UIK5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms