Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT172Q9UG01 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms