Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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