Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms