Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms