Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms