Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms