Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEBOXQ9HB31 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEBOXQ9HB31 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms