Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMURF2Q9HAU4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms