Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPR88Q9GZN0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPR88Q9GZN0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms