Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms