Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF407Q9C0G0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF407Q9C0G0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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