Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCGF6Q9BYE7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms