Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLDIP3Q9BY77 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms