Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOL6Q9BWW8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOL6Q9BWW8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOL6Q9BWW8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOL6Q9BWW8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOL6Q9BWW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOL6Q9BWW8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOL6Q9BWW8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOL6Q9BWW8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOL6Q9BWW8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms