Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRIP3Q9BW71 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms