Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms